内置式水箱自洁消毒器是属于臭氧杀菌是利用臭氧的强氧化杀菌原理，氧化细菌的细胞壁，使细胞内的细胞质流出，杀死细胞内的活性酶，分解遗传物质DNA和RNA，从而致死病原菌。

除绿藻水箱自洁消毒器可以改善且预防水质长期滞存，水质遭受病菌、微生物侵袭现状。具有杀菌灭藻速度快，光谱杀菌特性，无二次污染。